Agrandi et rénové en 1870, l’Hôtel Coffin brûlera complètement en 1878 suite à un incendie jugé accidentel. L’homme d’affaire John Baker entreprend alors la construction et la restauration d’un complexe d’hébergement qui portera désormais son nom, le Baker's Hotel.

L’hôtel de John Baker demeurera une entreprise familiale tout au long de son existence.Basé essentiellement sur les activités de chasse et de pêche finit par se retrouver dans une mauvaise posture, essentiellement à cause des nouvelles législations gouvernementales, qui éliminent tour à tour les clubs de pêches privé, afin de les remplacer en réserves provinciales.

Près de cinquante ans après des débuts modestes, l’hôtelier John Baker s’éteint en octobre 1930, laissant derrière lui un complexe touristique bien établi, dont la réputation est connu bien au-delà des frontières du Canada. Le Baker's Hotel sera longtemps reconnu comme un empire du loisir et représente un modèle très impressionnant de l’architecture complexe du début du siècle et des balbutiements du développement touristique gaspésien.

En 1972, des rénovations sont entreprises, afin d’ajouter 12 unités de motel supplémentaires. Coup sombre du hasard, le Baker's Hotel brûle, le 31 juillet 1975. Certaines propriétés avoisinantes sont transformées en maison d'appartements, quelques années plus tard.

Quelques mois après l’incendie, quatre employés du Cégep de la Gaspésie et des Îles décident de prendre en charge la construction d’un nouvel hôtel, au même endroit que l’ancien Hôtel Baker. Le bâtiment sera opérationnel, dès juin 1978, sous la bannière Auberge des Gouverneurs. Il comportera 44 chambres, ainsi que les 12 unités de motels précédemment construits comme addition à l’hôtel Baker.

En 2001, des changements et des agrandissements majeurs viennent transformer complètement la vocation de l’établissement. Ces changements se concrétiseront par l’ajout de 14 nouvelles chambres, d’un cinéma de 102 places, d’un centre de santé, de même que l’agrandissement de nos salles de conférences, du Resto Bar O’PUB, ainsi que de la salle à manger.

Confiant de notre savoir-faire, nous avons délaissé la bannière Quality Inn, afin de nous faire connaìtre sous le nom d’Hôtel des Commandants. Fier des nombreux services que nous offrons, notre but est maintenant de devenir une destination en soi.